Desktop Tower Defense не следва общия стил на игра Tower Defense. За разлика от много други игри за защита на кули, пътят на самите пълзящи не е зададен; вместо това построените кули определят пътя на пълзящите, които поемат по най-краткия път, който могат да намерят до изхода. Това ви позволява да изберете свой собствен начин на игра и също така дава възможност за много интересни стратегии.
Не само можете да повлияете на пътя, по който вървят пълзящите, но и ще трябва да управлявате финансите си и да решите дали е по-жизнеспособно да изградите повече кули или да надстроите съществуващите си. Стратегическото разположение на различни кули е от ключово значение, тъй като всяка кула има своето място и има специални способности.
Пълзенето идва на вълни на определени интервали. Всяка вълна от пълзения има различни характеристики, като имунитет към определени кули, допълнителна устойчивост към определени кули и способностите да хвърлят хайвера си, да се движат по-бързо от нормалното или да летят над кулите, вместо да следват лабиринта. За всяка вълна играта се върти сред видовете пълзи.